Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Usp9yF8VPU6 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Slc16a7-201ENSMUST00000063318 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Tbc1d24-208ENSMUST00000201089 4081 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Uqcrq-202ENSMUST00000109019 504 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm11348-201ENSMUST00000118813 318 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 2610001J05Rik-204ENSMUST00000185361 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 CT025579.4-201ENSMUST00000224598 627 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm9848-201ENSMUST00000053398 259 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Trak2-205ENSMUST00000174120 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Greb1-203ENSMUST00000159120 6346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Rpgr-203ENSMUST00000073392 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm37065-203ENSMUST00000192498 1622 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm45790-201ENSMUST00000211986 1629 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Styk1-201ENSMUST00000049150 3380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Mtbp-205ENSMUST00000170046 3197 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 AC154634.1-201ENSMUST00000225225 2394 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm5316-202ENSMUST00000185734 3096 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Scgb1b21-202ENSMUST00000182901 278 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Olfr312-201ENSMUST00000078217 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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Usp9yF8VPU6 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Usp9yF8VPU6 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Rimklb-206ENSMUST00000204731 3039 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm38236-201ENSMUST00000192661 3229 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Gm11690-201ENSMUST00000128183 1856 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Usp9yF8VPU6 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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