Protein–RNA interactions for Protein: B1B0V2

AU022751, Expressed sequence AU022751, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU022751B1B0V2 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Slc1a7-201ENSMUST00000106713 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Epn2-212ENSMUST00000178202 4317 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Cacng5-202ENSMUST00000106742 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Zfp638-201ENSMUST00000032088 6199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Olfr1350-202ENSMUST00000207221 1521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Kif3c-204ENSMUST00000219895 2962 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Stk11ip-202ENSMUST00000113553 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 D630033O11Rik-205ENSMUST00000210802 2761 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Nrep-203ENSMUST00000171533 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Trpv5-201ENSMUST00000031901 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 F630040K05Rik-201ENSMUST00000180519 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Pde6a-201ENSMUST00000025468 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Nol12-203ENSMUST00000138880 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Plcd4-202ENSMUST00000067916 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 A430048G15Rik-201ENSMUST00000149965 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 CT030705.2-201ENSMUST00000225301 556 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Gm7435-202ENSMUST00000216003 2424 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Pkp4-203ENSMUST00000112577 4222 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
AU022751B1B0V2 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms