Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Arhgap12-212ENSMUST00000182559 4265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Otoa-201ENSMUST00000047025 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Adgrg4-201ENSMUST00000096431 1137 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Hdac7-203ENSMUST00000116408 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Cdc6-202ENSMUST00000093937 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Pnpla1os-201ENSMUST00000146779 3946 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gapt-201ENSMUST00000058806 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm15616-201ENSMUST00000118662 375 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm11879-201ENSMUST00000121885 702 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm7694-201ENSMUST00000179801 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm18980-201ENSMUST00000199098 1079 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Mkl2-201ENSMUST00000009713 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Ces1g-201ENSMUST00000044602 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Dhx30-204ENSMUST00000196171 3885 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Tbc1d24-214ENSMUST00000201960 4305 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Fam19a3-201ENSMUST00000139783 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Vmn1r59-201ENSMUST00000074132 1439 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 AC153548.1-201ENSMUST00000219283 2661 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SacsQ9JLC8 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms