Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Ttc41-205ENSMUST00000219108 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm14616-201ENSMUST00000131690 314 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm45672-201ENSMUST00000209700 768 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 4930474N09Rik-201ENSMUST00000223511 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Syt11-202ENSMUST00000107503 3575 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Plekha5-206ENSMUST00000203774 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Olfr531-201ENSMUST00000080153 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Senp3Q9EP97 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Sult1a1-203ENSMUST00000106373 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Pcna-ps1-201ENSMUST00000118453 738 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Senp3Q9EP97 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Senp3Q9EP97 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Senp3Q9EP97 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Senp3Q9EP97 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Borcs8-201ENSMUST00000002418 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Senp3Q9EP97 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Senp3Q9EP97 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Senp3Q9EP97 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Senp3Q9EP97 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Senp3Q9EP97 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Senp3Q9EP97 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Senp3Q9EP97 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Senp3Q9EP97 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Senp3Q9EP97 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Senp3Q9EP97 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Senp3Q9EP97 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Senp3Q9EP97 Hps1-202ENSMUST00000069298 3196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Senp3Q9EP97 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Senp3Q9EP97 Gm8914-201ENSMUST00000101396 1035 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Senp3Q9EP97 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Senp3Q9EP97 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Senp3Q9EP97 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Senp3Q9EP97 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Senp3Q9EP97 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms