Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Pdgfra-208ENSMUST00000202681 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Steap4-201ENSMUST00000115421 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Mkl1-201ENSMUST00000109579 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Epb41l3-201ENSMUST00000080208 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Btg1-201ENSMUST00000038377 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Mrpl15-206ENSMUST00000156816 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Arhgef7-202ENSMUST00000074856 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm16026-206ENSMUST00000163068 2741 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 9930024M15Rik-201ENSMUST00000214902 2584 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Slc28a2-202ENSMUST00000110524 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm42788-201ENSMUST00000201604 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Ints10-202ENSMUST00000070713 4192 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Cdhr2-201ENSMUST00000037145 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Tagap-201ENSMUST00000036370 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Hnf4g-201ENSMUST00000108393 2224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 D830044D21Rik-201ENSMUST00000143315 3897 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 6430562O15Rik-202ENSMUST00000180808 3997 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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