Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Nos1-207ENSMUST00000171055 4388 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Pdzd9-202ENSMUST00000127845 1327 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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PtprdQ64487 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Gm37199-201ENSMUST00000193881 4065 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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PtprdQ64487 Gm7821-201ENSMUST00000117111 788 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Gm28983-201ENSMUST00000186685 614 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Gm28150-201ENSMUST00000187305 614 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Etl4-203ENSMUST00000114604 4786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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PtprdQ64487 Nup210l-202ENSMUST00000200410 5710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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PtprdQ64487 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Ikbkap-201ENSMUST00000030140 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Trpm1-218ENSMUST00000206277 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Lyg2-201ENSMUST00000078307 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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PtprdQ64487 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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PtprdQ64487 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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PtprdQ64487 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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PtprdQ64487 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Gm3512-201ENSMUST00000090663 441 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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PtprdQ64487 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Fancl-202ENSMUST00000109509 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
PtprdQ64487 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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