Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Zfp207-208ENSMUST00000188489 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Olfr523-203ENSMUST00000213953 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Rimklb-206ENSMUST00000204731 3039 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Nfam1-203ENSMUST00000109503 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 D630045J12Rik-206ENSMUST00000169256 10968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Prkar2b-203ENSMUST00000146865 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Trim21-202ENSMUST00000106913 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gbp8-201ENSMUST00000031235 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Spata48-202ENSMUST00000109678 753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Kpna3-201ENSMUST00000022496 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 5330417C22Rik-201ENSMUST00000048012 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm10302-201ENSMUST00000174433 3535 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ccdc18Q640L5 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms