Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm44854-201ENSMUST00000205493 2340 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Afm-201ENSMUST00000113179 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Zmym1-201ENSMUST00000055013 3001 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Fktn-201ENSMUST00000061771 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Aqp9-203ENSMUST00000113570 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm6556-201ENSMUST00000181118 362 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Olfr665-201ENSMUST00000098165 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PrcdQ00LT2 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms