Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TtrP07309 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TtrP07309 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TtrP07309 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TtrP07309 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TtrP07309 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 D130007C19Rik-201ENSMUST00000067277 1505 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TtrP07309 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TtrP07309 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm25607-201ENSMUST00000104020 127 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TtrP07309 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TtrP07309 Tctex1d2-201ENSMUST00000014220 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TtrP07309 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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TtrP07309 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TtrP07309 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TtrP07309 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 AC122354.1-201ENSMUST00000222328 702 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TtrP07309 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TtrP07309 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Clec3a-201ENSMUST00000009018 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
TtrP07309 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TtrP07309 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TtrP07309 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TtrP07309 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TtrP07309 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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TtrP07309 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm46995-201ENSMUST00000223445 1378 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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TtrP07309 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TtrP07309 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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