Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 4933427E13Rik-202ENSMUST00000125234 1493 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 2610037D02Rik-202ENSMUST00000185067 2997 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Kcnmb1-201ENSMUST00000020362 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Rnft1-201ENSMUST00000020827 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm45727-201ENSMUST00000212886 572 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm4739-201ENSMUST00000218296 633 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Zfp410-203ENSMUST00000220931 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 AC154766.1-201ENSMUST00000226550 936 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Cdca8-201ENSMUST00000030690 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Padi3-202ENSMUST00000172098 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm38322-201ENSMUST00000194074 2300 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Atp8b3-201ENSMUST00000020383 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm24605-201ENSMUST00000104772 96 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm11224-201ENSMUST00000120465 1111 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Alg13-203ENSMUST00000123710 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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