Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Olfr798-202ENSMUST00000204979 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 C330007P06Rik-202ENSMUST00000115248 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Nod2-202ENSMUST00000109634 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm24812-201ENSMUST00000175315 284 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 B230323A14Rik-201ENSMUST00000180488 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Rab43-201ENSMUST00000032134 4308 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Stk11ip-202ENSMUST00000113553 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Olfr1048-202ENSMUST00000215607 2981 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm12319-201ENSMUST00000131642 357 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 AU015336-201ENSMUST00000159040 849 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm24155-201ENSMUST00000175259 110 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm27186-201ENSMUST00000184223 307 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Dpp6-203ENSMUST00000120555 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Cd200r4-201ENSMUST00000114626 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 AC123842.1-201ENSMUST00000217622 3118 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Map4k4-217ENSMUST00000195636 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm43609-201ENSMUST00000199084 2712 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms