Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC154627.1-201ENSMUST00000228799 1286 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Lin54-202ENSMUST00000123572 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 9930014A18Rik-202ENSMUST00000181910 4116 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Rimklb-206ENSMUST00000204731 3039 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Mrps5-201ENSMUST00000028852 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Luc7l-202ENSMUST00000114976 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Ubap2l-208ENSMUST00000196843 3975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Aplnr-201ENSMUST00000057019 3699 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Olfr1219-202ENSMUST00000213724 5669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Hrh1-203ENSMUST00000160780 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm43839-201ENSMUST00000196183 2325 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm26748-201ENSMUST00000180406 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Itgam-205ENSMUST00000120355 3701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Ano9-201ENSMUST00000067836 3019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm44937-201ENSMUST00000207705 2691 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Epn2-213ENSMUST00000179936 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Pde6h-202ENSMUST00000137768 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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NischQ80TM9 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Scimp-201ENSMUST00000074572 617 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NischQ80TM9 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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