Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Ighv9-1-201ENSMUST00000103471 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Ighv9-2-201ENSMUST00000103472 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 BB218582-201ENSMUST00000123623 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm39090-202ENSMUST00000205992 508 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Evi2a-205ENSMUST00000170799 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm42744-201ENSMUST00000196517 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Nup210l-201ENSMUST00000029548 5681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Musk-203ENSMUST00000098057 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Nos1-207ENSMUST00000171055 4388 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm38352-201ENSMUST00000194459 2557 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PtprkP35822 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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