Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Olfr555-201ENSMUST00000098220 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm10132-201ENSMUST00000099431 468 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm31182-201ENSMUST00000219061 2391 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm9246-201ENSMUST00000117587 3490 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 2610203C22Rik-204ENSMUST00000148585 3475 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Uroc1-202ENSMUST00000164761 3462 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC161117.1-201ENSMUST00000221366 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Ano4-208ENSMUST00000182613 3880 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Adgrl3-218ENSMUST00000122037 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm44257-201ENSMUST00000204469 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm6554-201ENSMUST00000220592 1912 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 G730013B05Rik-201ENSMUST00000180509 2176 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC153526.3-201ENSMUST00000220145 2183 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm10069-201ENSMUST00000144745 3694 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Plekha8-201ENSMUST00000101385 1838 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Cep19-201ENSMUST00000042869 1567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Slamf9-201ENSMUST00000027830 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Sec31a-210ENSMUST00000182886 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Nme8-201ENSMUST00000039340 1704 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm4890-201ENSMUST00000181030 3784 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Kin-201ENSMUST00000042512 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Zfp677-202ENSMUST00000162659 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Slc31a1-201ENSMUST00000084526 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Ston1-205ENSMUST00000150023 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Serinc4-201ENSMUST00000056312 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Pcdh15-228ENSMUST00000152819 2867 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm20507-201ENSMUST00000163245 2860 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Dab1-201ENSMUST00000106826 996 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm14427-201ENSMUST00000117183 635 ntBASIC8□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Mettl8-205ENSMUST00000121586 1151 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Crem-209ENSMUST00000129435 1160 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm6723-201ENSMUST00000180449 441 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm17508-201ENSMUST00000181215 681 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 6530403H02Rik-201ENSMUST00000182099 402 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Pdlim5-209ENSMUST00000196908 1196 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 1700041I07Rik-201ENSMUST00000197536 435 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm42402-201ENSMUST00000208341 1054 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm32834-202ENSMUST00000222417 655 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC100209.1-201ENSMUST00000225562 409 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC124736.1-201ENSMUST00000226382 419 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 4930553J12Rik-201ENSMUST00000023648 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Dppa3-201ENSMUST00000049644 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Olfr1110-202ENSMUST00000152758 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gucy1b3-204ENSMUST00000193597 3171 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms