Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Dynlrb2-202ENSMUST00000213007 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Lhfpl2-202ENSMUST00000118195 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Pcdhb7-201ENSMUST00000053037 3501 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Sox6-206ENSMUST00000205405 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Drosha-201ENSMUST00000090292 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Gm42633-201ENSMUST00000198853 2764 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Pde6a-201ENSMUST00000025468 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Ehmt1-204ENSMUST00000114418 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Clcn7-201ENSMUST00000040729 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Gm42760-201ENSMUST00000199814 311 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Amigo3Q8C2S7 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Shc4-201ENSMUST00000042246 4059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Syt17-201ENSMUST00000081574 2764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Rbm25-201ENSMUST00000048155 4226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Il5ra-201ENSMUST00000167925 1704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Nos1-207ENSMUST00000171055 4388 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Amigo3Q8C2S7 Srp72-201ENSMUST00000101087 3625 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gucy2d-203ENSMUST00000206435 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 CT010577.1-202ENSMUST00000226187 1903 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Tnfrsf11b-201ENSMUST00000079772 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Atxn7l1-210ENSMUST00000144586 3042 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Olfr173-202ENSMUST00000206205 2778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Trpm1-218ENSMUST00000206277 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Tro-205ENSMUST00000151403 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Amigo3Q8C2S7 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Syne1-202ENSMUST00000095899 3443 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Mtmr4-202ENSMUST00000103179 5753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm37293-201ENSMUST00000191658 295 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Arhgap27-201ENSMUST00000041385 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Amigo3Q8C2S7 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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