Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Apex1-201ENSMUST00000049411 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Pcdh1-201ENSMUST00000057185 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Eif3c-201ENSMUST00000032992 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Elmo1-201ENSMUST00000072519 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm29507-201ENSMUST00000187378 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Slc25a44-201ENSMUST00000057935 3577 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Trim35Q8C006 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Trim35Q8C006 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Trim35Q8C006 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm26704-201ENSMUST00000181362 2901 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Atp2b2-202ENSMUST00000101044 4586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Trim35Q8C006 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Trim35Q8C006 Gm15472-201ENSMUST00000141652 847 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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Trim35Q8C006 1700009C05Rik-201ENSMUST00000191101 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Trim35Q8C006 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Trim35Q8C006 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Pigq-202ENSMUST00000097368 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm7103-201ENSMUST00000195642 1852 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Vma21-202ENSMUST00000114576 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Zfp446-201ENSMUST00000045810 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Trim35Q8C006 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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