Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm10136-201ENSMUST00000183196 435 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Chek2-201ENSMUST00000066160 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Sntg1-207ENSMUST00000140295 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Cacna1c-213ENSMUST00000188078 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Cacna1c-217ENSMUST00000188865 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Grb10-203ENSMUST00000109654 4755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm43599-201ENSMUST00000202680 528 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 A630001O12Rik-201ENSMUST00000212914 2182 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Slc5a4b-201ENSMUST00000120757 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Hipk2-207ENSMUST00000162359 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm24519-201ENSMUST00000104507 132 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm15265-202ENSMUST00000143287 814 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm16298-201ENSMUST00000161107 420 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm40797-201ENSMUST00000219762 385 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 AC124489.3-201ENSMUST00000224037 278 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Zmym5-203ENSMUST00000173954 5357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Pard3b-203ENSMUST00000094906 7676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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