Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Zfp758-204ENSMUST00000149699 2876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 AC161117.1-201ENSMUST00000221366 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 B230118H07Rik-203ENSMUST00000111231 2273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gpnmb-201ENSMUST00000031840 3701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Ap5s1-202ENSMUST00000110206 703 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm9392-201ENSMUST00000119337 554 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Olfr621-ps1-201ENSMUST00000119741 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm15571-201ENSMUST00000119887 637 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm6586-201ENSMUST00000167028 643 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm8857-201ENSMUST00000170064 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm28478-201ENSMUST00000185802 183 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm38033-201ENSMUST00000192037 269 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Thy1-204ENSMUST00000214627 446 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm34278-201ENSMUST00000220534 622 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 AC118250.2-201ENSMUST00000228890 416 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Ghrh-201ENSMUST00000029172 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 AC099612.1-201ENSMUST00000226318 1636 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 4930442J19Rik-202ENSMUST00000157058 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Fas-201ENSMUST00000025691 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Olfr152-203ENSMUST00000215394 2172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Cep19-201ENSMUST00000042869 1567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Ube2v1-201ENSMUST00000060645 1586 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Itgb1bp2-201ENSMUST00000033674 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps1O08983 1600012P17Rik-201ENSMUST00000062159 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hps1O08983 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms