Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Cdh18-203ENSMUST00000164787 2744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 1300002E11Rik-201ENSMUST00000180830 3557 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Map4k4-213ENSMUST00000193682 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Ap3b2-201ENSMUST00000082090 3804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Lrrc66-201ENSMUST00000087177 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Sox5-205ENSMUST00000111749 3879 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Egf-201ENSMUST00000029653 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gpr83-201ENSMUST00000034408 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Sec16b-203ENSMUST00000111700 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Ttc39b-203ENSMUST00000102823 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm4961-201ENSMUST00000197982 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Pnpla1os-201ENSMUST00000146779 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 L3mbtl2-204ENSMUST00000172748 3368 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm37949-201ENSMUST00000192808 2091 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 AC122251.1-201ENSMUST00000227717 639 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm42969-201ENSMUST00000199858 3631 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 9630001P10Rik-202ENSMUST00000181335 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Ddx5-201ENSMUST00000021062 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Csf2rb-201ENSMUST00000096355 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Nek6-201ENSMUST00000054234 10338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprtQ99M80 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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