Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Trpm8-201ENSMUST00000040210 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Sorbs1-202ENSMUST00000099467 2817 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Mctp2-201ENSMUST00000079323 5802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Stox2-202ENSMUST00000110367 3424 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 E330035G20Rik-201ENSMUST00000221094 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Hypk-202ENSMUST00000110612 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 Prkar2a-206ENSMUST00000195405 1143 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Mybpc2-201ENSMUST00000165208 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gpr22-203ENSMUST00000176710 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Rtel1-203ENSMUST00000098971 4307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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