Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Mon2-203ENSMUST00000170935 5302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Dlgap5-201ENSMUST00000043296 2964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm38352-201ENSMUST00000194459 2557 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Olfr572-202ENSMUST00000214096 1126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm43063-201ENSMUST00000198198 1081 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Nbr1-207ENSMUST00000107218 3353 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp54Q8BL06 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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