Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Map4k4-213ENSMUST00000193682 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm42497-201ENSMUST00000197363 1958 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm17027-201ENSMUST00000171202 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Arhgef9-207ENSMUST00000113885 4578 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Cmah-201ENSMUST00000050859 2444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr1090-203ENSMUST00000217043 2054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Npnt-201ENSMUST00000042729 3601 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Lrrc49-203ENSMUST00000114032 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm43792-201ENSMUST00000202492 2210 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm5997-201ENSMUST00000208154 1864 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Ggt5-201ENSMUST00000072217 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Bbs9-201ENSMUST00000039798 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Thsd1-203ENSMUST00000162447 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm38130-201ENSMUST00000194311 1761 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm18639-201ENSMUST00000210442 1769 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Supt5-201ENSMUST00000003527 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm5754-201ENSMUST00000118774 892 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm15532-201ENSMUST00000121192 884 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 D630024D03Rik-203ENSMUST00000134944 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm24994-201ENSMUST00000157414 121 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm20511-201ENSMUST00000174079 456 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm44020-201ENSMUST00000204618 664 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Serpinb6d-202ENSMUST00000221681 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC130219.2-201ENSMUST00000228765 807 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Glipr1-201ENSMUST00000074805 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr1286-201ENSMUST00000099617 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Pcdhb3-201ENSMUST00000051754 3787 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Lcorl-201ENSMUST00000016026 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Rmi1-205ENSMUST00000225828 3594 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Cdk12-202ENSMUST00000107538 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AU021092-201ENSMUST00000050160 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Ftsj1-203ENSMUST00000115595 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr954-202ENSMUST00000214818 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Foxp3-202ENSMUST00000115738 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Cenpi-202ENSMUST00000101251 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr152-203ENSMUST00000215394 2172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Pkd1l2-201ENSMUST00000098375 7386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Cacna1d-202ENSMUST00000112250 8688 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr549-202ENSMUST00000217478 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Raet1d-202ENSMUST00000182677 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gramd1c-202ENSMUST00000114677 3271 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Mitf-203ENSMUST00000101123 2144 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Aebp1-201ENSMUST00000102923 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Mitf-204ENSMUST00000113339 2144 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm14860-201ENSMUST00000120277 429 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm14300-201ENSMUST00000120800 946 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm8065-201ENSMUST00000164048 605 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Mir5625-201ENSMUST00000176598 80 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm43797-201ENSMUST00000198221 532 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Ociad1-204ENSMUST00000200935 1139 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms