Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 P2ry12-204ENSMUST00000199609 2157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC158954.1-201ENSMUST00000228272 1006 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Slc36a3-202ENSMUST00000069816 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm5619-201ENSMUST00000071172 760 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1178-201ENSMUST00000075640 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr412-201ENSMUST00000077794 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm23458-201ENSMUST00000083257 169 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Cbx1-203ENSMUST00000093943 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp1-203ENSMUST00000172901 1903 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm43161-201ENSMUST00000197020 1688 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm4858-203ENSMUST00000195847 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 1700010N08Rik-202ENSMUST00000188166 1323 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Cd59b-203ENSMUST00000111131 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Snhg17-202ENSMUST00000138592 342 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm15627-201ENSMUST00000140421 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm14573-201ENSMUST00000150544 451 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm20492-201ENSMUST00000172591 286 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm18828-201ENSMUST00000180475 857 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 AC139758.2-201ENSMUST00000228380 529 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Svs3b-201ENSMUST00000063132 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Tarm1-201ENSMUST00000065703 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Fabp5l2-201ENSMUST00000072582 408 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Kng1-201ENSMUST00000023589 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm5975-201ENSMUST00000185256 1399 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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