Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Olfr1396-201ENSMUST00000060398 3946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm13262-201ENSMUST00000149014 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm26480-201ENSMUST00000122619 297 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Cox7c-203ENSMUST00000131011 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 AC151971.2-201ENSMUST00000217540 909 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Olfr290-201ENSMUST00000073468 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Nckap1l-201ENSMUST00000047405 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Grip1-210ENSMUST00000144825 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 AC156802.2-201ENSMUST00000225239 5740 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Nphp4P59240 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm6166-201ENSMUST00000098689 409 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 AI314278-202ENSMUST00000209026 2373 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Nphp4P59240 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms