Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm27008-202ENSMUST00000182414 604 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Nxpe1-ps-202ENSMUST00000210160 956 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm38173-201ENSMUST00000193126 2314 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm11907-201ENSMUST00000118918 1007 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm9670-201ENSMUST00000121201 540 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Pogk-201ENSMUST00000127596 769 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm37108-201ENSMUST00000194605 626 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm43555-201ENSMUST00000196588 310 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm19254-201ENSMUST00000204828 294 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Olfr698-201ENSMUST00000074981 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Olfr155-201ENSMUST00000095108 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Prpf18-201ENSMUST00000035721 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Igkv6-29-201ENSMUST00000103379 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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