Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Pknox2-207ENSMUST00000177218 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Ebf2-201ENSMUST00000022637 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Bud31-207ENSMUST00000162594 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 4930535O05Rik-201ENSMUST00000184406 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 AC158799.1-201ENSMUST00000214686 617 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm21321-201ENSMUST00000220179 446 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Cpne4-203ENSMUST00000098443 1421 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Efhb-201ENSMUST00000024725 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Tpd52l2-208ENSMUST00000149163 3603 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm28977-201ENSMUST00000188678 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Galnt11-203ENSMUST00000114952 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Rps19-ps2-201ENSMUST00000100614 438 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Myl1-202ENSMUST00000119429 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm8172-201ENSMUST00000120762 750 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Olfr268-ps1-201ENSMUST00000121395 945 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Rps19-ps1-201ENSMUST00000168472 438 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Prrt4B2RU40 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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