Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h4h-201ENSMUST00000102972 470 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gabarap-202ENSMUST00000108592 750 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24039-201ENSMUST00000157878 132 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17828-201ENSMUST00000183380 799 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44588-201ENSMUST00000208401 545 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC124712.1-201ENSMUST00000221833 445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gnpnat1-202ENSMUST00000226276 710 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr518-201ENSMUST00000059617 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC125487.1-201ENSMUST00000217888 1300 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pecam1-201ENSMUST00000068021 2977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34297-201ENSMUST00000218569 1980 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15520-201ENSMUST00000132097 1203 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Bnip1-206ENSMUST00000135824 629 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tmsb10-204ENSMUST00000144337 433 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15347-201ENSMUST00000145372 385 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 2810429I04Rik-204ENSMUST00000185835 923 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28609-201ENSMUST00000186515 463 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr664-202ENSMUST00000211596 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18339-201ENSMUST00000218074 888 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC130829.2-201ENSMUST00000222931 127 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Thyn1-201ENSMUST00000039161 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap7-1-201ENSMUST00000056118 620 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr304-201ENSMUST00000077210 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1280-201ENSMUST00000082167 1003 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1283-201ENSMUST00000090328 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms