Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Trim35Q8C006 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Rimbp2-201ENSMUST00000111346 4264 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Eci2-213ENSMUST00000178421 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Sftpa1-202ENSMUST00000170719 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Adamts4-202ENSMUST00000111315 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Trim35Q8C006 Gm26705-201ENSMUST00000180761 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Mkrn1-204ENSMUST00000114823 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ttll1-203ENSMUST00000109480 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Trim35Q8C006 Tsr2-202ENSMUST00000112683 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Lrrcc1-202ENSMUST00000108370 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm12996-201ENSMUST00000151670 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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