Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Ftmt-201ENSMUST00000025388 1451 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Pdgfd-201ENSMUST00000058692 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Grip1-210ENSMUST00000144825 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 Gm15763-201ENSMUST00000120136 403 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Lmx1a-201ENSMUST00000028003 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Fnbp1-207ENSMUST00000113559 4378 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm12239-201ENSMUST00000134285 500 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp47Q8BY87 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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