Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 AC174678.3-201ENSMUST00000227568 362 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Fam161b-201ENSMUST00000021659 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Mstn-202ENSMUST00000191197 2461 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Chid1-203ENSMUST00000118694 3910 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm15188-201ENSMUST00000121264 704 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm38256-201ENSMUST00000192097 950 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Olfr272-203ENSMUST00000213989 1973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm7240-202ENSMUST00000221961 353 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Dlc1-206ENSMUST00000163663 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Prdm10-201ENSMUST00000074510 3408 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Fancl-201ENSMUST00000004120 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm6327-201ENSMUST00000171185 1335 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm4972-201ENSMUST00000211108 1254 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 D730003K21Rik-202ENSMUST00000217456 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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