Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Pla2g4d-201ENSMUST00000094665 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Synj2-208ENSMUST00000115789 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm20685-201ENSMUST00000176654 489 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm20767-202ENSMUST00000225683 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Pex5l-210ENSMUST00000193681 3620 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Rasgrf2-201ENSMUST00000099326 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm10364-202ENSMUST00000153034 1001 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Egf-202ENSMUST00000197079 3346 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Ighv14-4-201ENSMUST00000103475 333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm9359-201ENSMUST00000163721 1221 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Clcn7-201ENSMUST00000040729 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Pcsk2-201ENSMUST00000028905 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
NischQ80TM9 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm8362-201ENSMUST00000168790 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Nos1-207ENSMUST00000171055 4388 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Aldh2-201ENSMUST00000031411 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Zfp638-201ENSMUST00000032088 6199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NischQ80TM9 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms