Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm42899-201ENSMUST00000197034 2667 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Myo1h-205ENSMUST00000169347 3545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Tmsb15a-202ENSMUST00000113154 544 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Pinlyp-201ENSMUST00000011776 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm13005-201ENSMUST00000119518 585 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 4930519F09Rik-202ENSMUST00000163084 1111 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Zfp493-203ENSMUST00000181319 730 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm8686-201ENSMUST00000203028 388 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Rpl18a-ps4-201ENSMUST00000206176 536 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm45299-201ENSMUST00000210199 420 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm8058-201ENSMUST00000217247 587 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 4930521O17Rik-201ENSMUST00000219339 491 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 AC122774.1-201ENSMUST00000227703 762 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 AC158519.1-201ENSMUST00000228615 179 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 4930553J12Rik-201ENSMUST00000023648 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Olfr418-201ENSMUST00000059754 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Olfr514-201ENSMUST00000084754 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Ppfibp2-202ENSMUST00000098134 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Lcp1-206ENSMUST00000131802 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm44185-201ENSMUST00000204539 3307 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm8818-201ENSMUST00000110797 1047 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm43607-201ENSMUST00000199524 336 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm40304-201ENSMUST00000202154 268 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Cd28P31041 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms