Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Lyn-202ENSMUST00000103010 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pex5l-210ENSMUST00000193681 3620 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37620-201ENSMUST00000192910 501 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pcsk2-201ENSMUST00000028905 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44503-201ENSMUST00000149692 4383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Me1-202ENSMUST00000185374 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38056-201ENSMUST00000193928 5027 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 H6pd-202ENSMUST00000084117 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Tex9-201ENSMUST00000085358 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1219-202ENSMUST00000213724 5669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g4d-201ENSMUST00000094665 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Otx2-210ENSMUST00000227404 2086 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Rtl5-201ENSMUST00000113631 4653 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44835-201ENSMUST00000205544 3181 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2975-201ENSMUST00000209710 820 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Myo1f-201ENSMUST00000087605 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Pex5l-208ENSMUST00000192093 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44937-201ENSMUST00000207705 2691 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rb1cc1Q9ESK9 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Clcn7-201ENSMUST00000040729 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rb1cc1Q9ESK9 Epb42-202ENSMUST00000102490 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms