Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gapt-202ENSMUST00000224534 2016 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Fut10-204ENSMUST00000161788 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC117648.1-201ENSMUST00000219777 2510 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ptpn7-202ENSMUST00000167080 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gtpbp8-204ENSMUST00000162512 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Atcay-201ENSMUST00000047408 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm7882-201ENSMUST00000177915 1762 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Zfp87-203ENSMUST00000181573 382 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm6457-201ENSMUST00000066378 815 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Tbc1d14-203ENSMUST00000126077 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AU021092-201ENSMUST00000050160 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm10339-202ENSMUST00000181509 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm28042-202ENSMUST00000129685 4472 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm13481-201ENSMUST00000127672 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms