Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Olfr1427-201ENSMUST00000087825 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Flii-201ENSMUST00000002889 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Ttc41-203ENSMUST00000217747 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Crispld1-201ENSMUST00000095075 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Luc7l-202ENSMUST00000114976 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm12175-201ENSMUST00000122081 345 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Rtkn2-202ENSMUST00000105437 3932 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Adgrl3-213ENSMUST00000120292 5026 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Tdrd1-203ENSMUST00000111606 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Kcnip4-204ENSMUST00000166924 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Scfd2-201ENSMUST00000072857 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprkP35822 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprkP35822 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprkP35822 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtprkP35822 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Casp14-202ENSMUST00000219237 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Cc2d2a-201ENSMUST00000048150 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Eya3-202ENSMUST00000079157 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Creb5-202ENSMUST00000203487 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm19972-201ENSMUST00000218180 5664 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Dab1-201ENSMUST00000106826 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
PtprkP35822 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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