Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

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Length 1,604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 2210409E12Rik-201ENSMUST00000122062 346 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Hecw1Q8K4P8 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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Hecw1Q8K4P8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Tcp10a-204ENSMUST00000138222 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hecw1Q8K4P8 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hecw1Q8K4P8 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hecw1Q8K4P8 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Hecw1Q8K4P8 Me1-202ENSMUST00000185374 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Nrxn3-201ENSMUST00000057634 4634 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hecw1Q8K4P8 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Hecw1Q8K4P8 Tyrp1-201ENSMUST00000006151 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Hnf4g-201ENSMUST00000108393 2224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Smoc1-202ENSMUST00000110347 3496 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Hecw1Q8K4P8 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Hecw1Q8K4P8 Kpna6-202ENSMUST00000102590 5710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hecw1Q8K4P8 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Cass4-202ENSMUST00000103073 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Hecw1Q8K4P8 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Wfdc5-201ENSMUST00000045127 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Gm22707-201ENSMUST00000103834 110 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hecw1Q8K4P8 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms