Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptbp3-210ENSMUST00000173699 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1414-201ENSMUST00000062353 6017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calcr-201ENSMUST00000075644 3763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5330417C22Rik-201ENSMUST00000048012 3321 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D7Bwg0826e-201ENSMUST00000208484 3795 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hrh1-205ENSMUST00000161650 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgb6-202ENSMUST00000059888 4806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcbtb2-218ENSMUST00000169479 3351 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpsf6-208ENSMUST00000177145 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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