Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm5114W4VSN8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm5114W4VSN8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm5114W4VSN8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm5114W4VSN8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms