Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc166S4R181 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc166S4R181 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms