Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Homer1Q9Z2Y3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Homer1Q9Z2Y3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Homer1Q9Z2Y3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms