Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cldn8Q9Z260 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cldn8Q9Z260 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms