Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HnrnpcQ9Z204 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HnrnpcQ9Z204 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms