Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W4

Gdf11, Growth/differentiation factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf11Q9Z1W4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdf11Q9Z1W4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdf11Q9Z1W4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf11Q9Z1W4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf11Q9Z1W4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf11Q9Z1W4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf11Q9Z1W4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gdf11Q9Z1W4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf11Q9Z1W4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gdf11Q9Z1W4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms