Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Thbs4Q9Z1T2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Thbs4Q9Z1T2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms