Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ap3b1Q9Z1T1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ap3b1Q9Z1T1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms