Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VarsQ9Z1Q9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VarsQ9Z1Q9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms