Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfrp4Q9Z1N6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sfrp4Q9Z1N6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms