Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NgfrQ9Z0W1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NgfrQ9Z0W1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms