Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.32■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.31■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.3■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.3■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.29■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
S1pr4Q9Z0L1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
S1pr4Q9Z0L1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms