Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap4s1Q9WVL1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ap4s1Q9WVL1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms